聯賽分兩階段，每階段兩循環。兩階段冠軍進行決賽決出聯賽冠軍。
1996/1997年度球季，港甲有十支球隊參加。但港會降班、發景和民信又退出。再加上乙組沒有球隊升班，1996/1997年球季就只得以下七支球隊參加：快譯通、南華、東方、愉園、星島、流浪、好易通。結果快譯通與南華分奪第一階段和第二階段聯賽冠軍。聯賽決賽當日，南華靠鄭兆聰加時的黃金入球以三比二擊敗快譯通，報回上季聯賽決賽一箭之仇。
由於當屆甲組只得七隊，高級組銀牌賽制改以雙淘汰方式，即一支球隊要落敗兩次才出局。南華在次圈不敵快譯通後，成為負方冠軍。決賽南快再遇，南華以三比一取勝。因此雙方要再踢一場。在大球場二萬九千名球迷面前，南華憑新援洛奴域射入黃金入球奪走錦標。不過，當年有觀戰的球迷應該對吳群立那兩腳自由球印象更深。南華與快譯通在聯賽連同聯賽決賽五度相遇，在銀牌賽又三次碰頭，全季在正式賽事對碰了八次。
總督盃和足總盃方面則仍用單淘汰制。但為了湊夠八支球隊參加，港會和二合分別得到了總督盃和足總盃的參賽資格。二合還特邀前英格蘭國門施路頓到旺角場把關。這兩項錦標分別由星島和快譯通贏得。
當屆東方包尾降班，而二合聯同五一七升上甲組，令翌年甲組球隊增至八隊。