在各行車綫、機場快綫、輕鐵、巴士、城際列車、高速鐵路 車站 及 車廂 內外，由最傳統的紙牌、燈箱，到 2000 年代初出面世的電子螢幕、電視畫面廣告，都按地域而定，分別由五間廣告代理公司負責定價，並處理日常廣告業務。
廣告代理負責範圍如下：
- 市區綫、機場鐵路：JCDecaux Transport 德高貝登
- 東、西鐵綫、馬鞍山綫、高速鐵路、輕鐵、港鐵巴士：Asiaray 雅士維
- 尖東站行人隧道：Focus Media 基石金融
- 城際列車：HK Easy Shop Limited 中港直購
- 港鐵車廂電視：HKC News Express 有線新聞速遞
至目前為止，於港鐵網絡中最大規模的廣告代理，分別係負責市區綫、機場鐵路的「德高貝登」；以及負責東、西鐵綫、馬鞍山綫 及 高速鐵路的「雅士維」。
各行各業的商戶於這些平台宣傳自己的業務，首先要聯絡廣告代理，廣告代理會對照稿件內容是否有違法、色情等成分，以及有否抵觸該公司自己的守則後，方會再傳閱到港鐵公司的市務部、車務營運主管、技術及工程事務部，確保廣告不會影響乘客觀感，或鐵路安全運作後，片可於鐵路處所刊登
過去就有商家直接使用綠色出口圖案，來標示自己店舖的位置，令人誤會車站緊急通道嘅方向，同時有違消防處的要求。亦有廣告影片內容，包括大量科幻特技效果，令畫面在路軌旁不停閃爍，可能會妨礙車長駕駛，而要於刊登前再三修改，因此部分廣告代理都會要求客戶，於廣告刊出前一再修改內容。
亦有其他的例子則出現於較繁忙的轉車站上，是部分巨型廣告貼紙遮蓋月台本來的紙皮石顏色，令乘客於繁忙時間的車廂內難以分辨自己仍在金鐘，抑或已抵達尖沙咀，因此市務部日後亦要求廣告代理在站名標字樣附近預留更多空位，避免「影響乘客觀感」。
最近一個大家都有留意，關於多元性向的廣告，就曾於廣告代理公司處理有否抵觸該公司守則的期間，需要延遲刊出。
其實，港鐵公司過去幾年亦以社會公益的方式，贊助多個廣告位予 Hong Kong Pride Parade 香港同志遊行，實踐防止任何形式歧視、平等機會嘅公司政策，亦因此近年即使係選舉廣告，同樣會喺鐵路處所見到。
公司的《工作操守及指引》亦有清楚列明：
我們絕不容忍工作環境內任何形式的騷擾或歧視，不論是基於性別、性取向、殘疾、年齡、種族、膚色、國籍或人種、家庭崗位，還是在我們營運地區內其他受保障的特質。公司的反歧視政策適用於招聘、晉升、調職、獎勵、培訓等有關範疇。
經今次的了解後，港鐵公司亦已經同各廣告代理充份溝通，確保佢地嘅內部守則唔會抵觸公司對平等機會，以及多元化嘅承諾